Hanno Millesi nació el 24-marzo-1927 en Villach (Austria), siendo hijo de un médico de cabecera. Pasó su juventud en Kärsten, donde hizo sus estudios de bachillerato. Tras hacer su servicio militar, estudió Medicina en la Facultad de Innsbruck, graduándose en 1951.

Su primer puesto de trabajo lo tuvo en el Hospital Wilhelminen de Viena, donde se formó en Medicina Interna y en Anatomía Patológica. En 1953 fue admitido en el Departamento de Cirugía de la Clínica Universitaria de Viena. Durante los dos primeros años se formó con el Dr. L. Schönbauer en el Servicio de Cirugía General, y a continuación se incorporó al Servicio de Cirugía Plástica que dirigía la Dra. E. Winkler, en el que permaneció un año, en el cual hizo su primera salida al extranjero, visitando al cirujano plástico A. Ragnell en Estocolmo.